biology/bedtools/pkg-descr

   1 The bedtools utilities are a suite of tools for performing a wide range of
   2 genomics analysis tasks.  The most widely-used of these tools enable genome
   3 arithmetic, i.e., set theory on the genome.  For example, with bedtools one
   4 can intersect, merge, count, complement, and shuffle genomic intervals from
   5 multiple files in common genomic formats such as BAM, BED, GFF/GTF, and VCF.
   6
   7 Although each individual utility is designed to do a relatively simple task,
   8 e.g., intersect two interval files, more sophisticated analyses can be
   9 conducted by stringing together multiple bedtools operations on the command
  10 line or in shell scripts.
  11
  12 WWW: http://bedtools.readthedocs.org/