biology/migrate/files/patch-Makefile.in

   1 --- Makefile.in.orig    2015-06-24 02:57:05 UTC
   2 +++ Makefile.in
   3 @@ -89,7 +89,7 @@ PAPERFORMAT       = @PAPERFORMAT@
   4  # -DINTEGRATEDLIKE may be used to get a marginal likelihood different to the current thermodynamic integr and harmonic mean [does not work]
   5  # -UEP calculates unique event polymorphism [not checked in a long time -- most likely does not work]
   6  NEWSTUFF          =  -DNEXUSTREE
   7 -COMMONFLAGS       = $(ARCH) $(MACOSVERSION) $(NEWSTUFF) $(HAVE_ZNZ) -DHIGHBITS -DHAVE_CONFIG_H -DHAVE_MALLOCWRAP $(CFLAGS_MT) $(HARDWARECFLAGS)
   8 +COMMONFLAGS       = $(MACOSVERSION) $(NEWSTUFF) $(HAVE_ZNZ) -DHIGHBITS -DHAVE_CONFIG_H -DHAVE_MALLOCWRAP $(CFLAGS_MT) $(HARDWARECFLAGS)
   9  #
  10  # combine the common flags with the version number and subversion number
  11  COMMONVFLAGS      =  $(COMMONFLAGS)  -DMIGRATESUBVERSION=\"\\\"$(MIGRATESUBVERSION)\\\"\"
  12 @@ -544,4 +544,4 @@ parallel_short_test::
  13  #----------------------------------------------------------------
  14  # BEAGLE
  15  beagle:
  16 -       $(MAKE) $(NAME) "CFLAGS = $(DEBUGCFLAGS)  $(BEAGLEFLAGS) $(PRETTYCFLAGS)" "LIBS = $(PDFLIB) $(LIBS)"  "LDFLAGS =$(LDFLAGS) $(EXCEPTIONS) `pkg-config /Users/beerli/src/beagle-lib/hmsbeagle-1.0.pc --cflags --libs` -framework OpenCL"
  17 \ No newline at end of file
  18 +       $(MAKE) $(NAME) "CFLAGS = $(DEBUGCFLAGS)  $(BEAGLEFLAGS) $(PRETTYCFLAGS)" "LIBS = $(PDFLIB) $(LIBS)"  "LDFLAGS =$(LDFLAGS) $(EXCEPTIONS) `pkg-config /Users/beerli/src/beagle-lib/hmsbeagle-1.0.pc --cflags --libs` -framework OpenCL"