contrib/file/magic/Magdir/scientific

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   2 #------------------------------------------------------------------------------
   3 # $File: scientific,v 1.12 2017/03/17 22:20:22 christos Exp $
   4 # scientific:  file(1) magic for scientific formats
   5 #
   6 # From: Joe Krahn <krahn@niehs.nih.gov>
   7
   8 ########################################################
   9 # CCP4 data and plot files:
  10 0       string          MTZ\040         MTZ reflection file
  11
  12 92      string          PLOT%%84        Plot84 plotting file
  13 >52     byte            1               , Little-endian
  14 >55     byte            1               , Big-endian
  15
  16 ########################################################
  17 # Electron density MAP/MASK formats
  18
  19 0       string          EZD_MAP NEWEZD Electron Density Map
  20 109     string          MAP\040(  Old EZD Electron Density Map
  21
  22 0       string/c        :-)\040Origin   BRIX Electron Density Map
  23 >170    string          >0      , Sigma:%.12s
  24 #>4     string          >0      %.178s
  25 #>4     addr            x       %.178s
  26
  27 7       string          18\040!NTITLE   XPLOR ASCII Electron Density Map
  28 9       string          \040!NTITLE\012\040REMARK       CNS ASCII electron density map
  29
  30 208     string          MAP\040 CCP4 Electron Density Map
  31 # Assumes same stamp for float and double (normal case)
  32 >212    byte            17      \b, Big-endian
  33 >212    byte            34      \b, VAX format
  34 >212    byte            68      \b, Little-endian
  35 >212    byte            85      \b, Convex native
  36
  37 ############################################################
  38 # X-Ray Area Detector images
  39 0       string  R-AXIS4\ \ \    R-Axis Area Detector Image:
  40 >796    lelong  <20             Little-endian, IP #%d,
  41 >>768   lelong  >0              Size=%dx
  42 >>772   lelong  >0              \b%d
  43 >796    belong  <20             Big-endian, IP #%d,
  44 >>768   belong  >0              Size=%dx
  45 >>772   belong  >0              \b%d
  46
  47 0       string  RAXIS\ \ \ \ \  R-Axis Area Detector Image, Win32:
  48 >796    lelong  <20             Little-endian, IP #%d,
  49 >>768   lelong  >0              Size=%dx
  50 >>772   lelong  >0              \b%d
  51 >796    belong  <20             Big-endian, IP #%d,
  52 >>768   belong  >0              Size=%dx
  53 >>772   belong  >0              \b%d
  54
  55
  56 1028    string  MMX\000\000\000\000\000\000\000\000\000\000\000\000\000 MAR Area Detector Image,
  57 >1072   ulong   >1              Compressed(%d),
  58 >1100   ulong   >1              %d headers,
  59 >1104   ulong   >0              %d x
  60 >1108   ulong   >0              %d,
  61 >1120   ulong   >0              %d bits/pixel
  62
  63 # Type: GEDCOM genealogical (family history) data
  64 # From: Giuseppe Bilotta
  65 0       search/1/c      0\ HEAD         GEDCOM genealogy text
  66 >&0     search          1\ GEDC
  67 >>&0    search          2\ VERS         version
  68 >>>&1   string          >\0             %s
  69 # From: Phil Endecott <phil05@chezphil.org>
  70 0       string  \000\060\000\040\000\110\000\105\000\101\000\104                GEDCOM data
  71 0       string  \060\000\040\000\110\000\105\000\101\000\104\000                GEDCOM data
  72 0       string  \376\377\000\060\000\040\000\110\000\105\000\101\000\104        GEDCOM data
  73 0       string  \377\376\060\000\040\000\110\000\105\000\101\000\104\000        GEDCOM data
  74
  75 # PDB: Protein Data Bank files
  76 # Adam Buchbinder <adam.buchbinder@gmail.com>
  77 #
  78 # http://www.wwpdb.org/documentation/format32/sect2.html
  79 # http://www.ch.ic.ac.uk/chemime/
  80 #
  81 # The PDB file format is fixed-field, 80 columns. From the spec:
  82 #
  83 # COLS        DATA
  84 #  1 -  6      "HEADER"
  85 #  11 - 50     String(40)
  86 #  51 - 59     Date
  87 #  63 - 66     IDcode
  88 #
  89 # Thus, positions 7-10, 60-62 and 67-80 are spaces. The Date must be in the
  90 # format DD-MMM-YY, e.g., 01-JAN-70, and the IDcode consists of numbers and
  91 # uppercase letters. However, examples have been seen without the date string,
  92 # e.g., the example on the chemime site.
  93 0       string  HEADER\ \ \ \040
  94 >&0     regex/1l        \^.{40}
  95 >>&0    regex/1l        [0-9]{2}-[A-Z]{3}-[0-9]{2}\ {3}
  96 >>>&0   regex/1ls       [A-Z0-9]{4}.{14}$
  97 >>>>&0  regex/1l        [A-Z0-9]{4}     Protein Data Bank data, ID Code %s
  98 !:mime  chemical/x-pdb
  99 >>>>0   regex/1l        [0-9]{2}-[A-Z]{3}-[0-9]{2}      \b, %s
 100
 101 # Type: GDSII Stream file
 102 0       belong  0x00060002      GDSII Stream file
 103 >4      byte    0x00
 104 >>5     byte    x               version %d.0
 105 >4      byte    >0x00           version %d
 106 >>5     byte    x               \b.%d
 107
 108 # Type: LXT (interLaced eXtensible Trace)
 109 # chrysn <chrysn@fsfe.org>
 110 0       beshort 0x0138  interLaced eXtensible Trace (LXT) file
 111 >2      beshort >0      (Version %u)