biology/bcftools/files/patch-misc_run-roh.pl

   1 --- misc/run-roh.pl.orig        2017-10-18 09:33:24 UTC
   2 +++ misc/run-roh.pl
   3 @@ -97,7 +97,7 @@ sub cmd
   4      else
   5      {
   6          # child
   7 -        exec('/bin/bash', '-o','pipefail','-c', $cmd) or error("Failed to run the command [/bin/sh -o pipefail -c $cmd]: $!");
   8 +        exec('/bin/sh', '-c', $cmd) or error("Failed to run the command [/bin/sh -c $cmd]: $!");
   9      }
  10
  11      if ( exists($args{exit_on_error}) && !$args{exit_on_error} ) { return @out; }