biology/p5-Bio-NEXUS/pkg-descr

   1 Bio::NEXUS package provides an object-oriented, Perl-based
   2 applications programming interface (API) to the NEXUS file
   3 format of Maddison, et al., 1997 (Syst. Biol. 46:590-621).
   4 NEXUS is a powerful and extensible format designed for use
   5 in evolutionary analysis, including the analysis of molecular
   6 sequence data as well as classical morphological and life-history
   7 data. NEXUS is the input or output format for software such as
   8 PAUP*, MacClade, Mesquite, SIMMAP, MrBayes, Nexplorer, and
   9 so on.  This package also contains the demonstration applications
  10 nexplot.pl (plot character data with a tree) and nextool.pl
  11 (allowing programmatic editing, e.g., selecting particular
  12 clades or subsets of data).
  13
  14 WWW: http://search.cpan.org/dist/Bio-NEXUS/